龙岩慈爱医院儿童康复部业新址建筑面积4000平米，内设康复评定室、儿童神经行为评定室、脑瘫及运动障碍康复部、智力及语言康复部、孤独症康复部、聋儿语训部、作业治疗部的综合性儿童康复疗育中心。同时开展儿童经颅磁刺激、经颅电刺激、肉毒毒素A注射、系列石膏、肌内效贴等儿童康复新技术的应用。

儿童康复医学部在省内康复专家、国务院津贴获得者沈敏海主任医师带领下，由各类儿童康复医师、治疗师、康复护理师、特教老师近百人组成儿童康复团队，开展临床诊断、康复评定、运动（PT）、作业（OT）、语言（ST）、矫形器、传统康复、特教、康复护理各项儿童康复二级专业工作，2014年获福建省政府扶残助残先进集体称号。